Hvordan beregne mutasjonshastigheter

Forfatter: John Webb
Opprettelsesdato: 13 August 2021
Oppdater Dato: 14 November 2024
Anonim
Luria and Delbruck test and mutation rate calculation
Video: Luria and Delbruck test and mutation rate calculation

Innhold

Mutasjonshastigheten er sjansen for at et nukleotid blir utelatt eller endret i DNA forårsaket enten av naturlige feil i DNA-prosessering (spontan mutasjon) eller av eksterne midler (indusert mutasjon). Denne frekvensen skal ikke forveksles med mutasjonsfrekvensen, som er antall forekomster av mutasjon i en gitt generasjon. Mutasjonshastigheten for en bestemt art ekstrapoleres vanligvis fra data, og sammenligner alle DNA-sekvenser i et tverrsnitt av artene med de av deres etterkommere. I laboratoriet gjøres dette vanligvis ved å isolere en prøve av arter og la dem formere seg over flere generasjoner.

Beregning av artsmutasjonshastigheten

Trinn 1

For å forenkle prosessen, få en prøvegruppe av hermafrodittarter (som gjødsler sine egne egg og ikke trenger partnere) som avler raskt og som du kan reprodusere levekår i et laboratorium. Caenorhabditis Elegans er en liten art av rundorm som oppfyller disse kriteriene og har blitt testet for mutasjonshastighet tidligere.


Steg 2

Sekvens og registrer DNA av din art.

Trinn 3

Isoler så mange individer av forskjellige arter som mulig for deg å administrere, vedlikeholde og observere i lang tid under forhold der det er kjent at skapningen trives. Dette minimerer effekten av naturlig utvalg ved å redusere den genetiske prøven.

Trinn 4

For hver generasjon av arter, hold bare ett avkom.

Trinn 5

La så mange generasjoner som mulig oppstå og dø, og legg merke til nøyaktig hvor mange generasjoner som gikk for hver slekt.

Trinn 6

Ta en tilfeldig eller fullstendig DNA-prøve fra ditt endelige avkom og sammenlign det med sekvensen til den opprinnelige arten. Telle antall endringer.

Trinn 7

På slutten av eksperimentet, bruk følgende ligning for å beregne mutasjonshastigheten for arten din: µ = m / (L x g x b)

hvor: µ = mutasjonshastighet m = antall observerte mutasjoner L = antall eksperimentelle stammer g = gjennomsnittlig antall generasjoner b = antall sekvenserte basepar