Innhold
Proteiner dannes fra polymer- eller aminosyrekjeder. Aminosyresekvensen (sammen med eventuelle modifikasjoner) bestemmer hvilken proteinstruktur den vil vedta. Proteiner har fire strukturnivåer: primær, sekundær, tertiær og kvaternær. Den primære strukturen er bare aminosyresekvensen, mens den sekundære strukturen refererer til 3-D-strukturen vedtatt av segmenter av aminosyrekjeden.
Alfa helix
En alfa helix er en svært vanlig type sekundær struktur der kjeden av aminosyrer vri for å danne en delikat spole. Nitrogen i petidbindingen i hver aminosyre har en hydrogen bundet til den slik at den kan danne en type interaksjon kalt en hydrogenbinding med oksygenatomet i karbonylgruppen i hver binding. Hydrogenbindinger holder propellen sammen og hjelper den å opprettholde sin form.
Sidekjeder
Alle aminosyre sidekjeder i en alfa helix peker utover, noe som gjør en komplett sløyfe hver 3. 3 aminosyrer. Propellen er vridet med klokken, så det er noen ganger beskrevet som "høyre". Et protein kan inkludere flere alfa-helikser, og noen proteiner som keratin (proteinet funnet i hår og negler) har denne typen struktur over det meste av lengden.
Beta ark
Et beta-ark holdes også sammen av hydrogenbindinger, men i dette tilfelle er to områder av polypeptidet plassert side om side, og hydrogenbindingene holder dem sammen i en slags plissert ark papir. De sammenkoblede ledningene kan enten rotere i motsatte retninger, i hvilket tilfelle de er antiparallelle, eller de kan være parallelle, med begge trådene som deler samme retning. Det antiparallelle arrangementet er mer vanlig. Aminosyre sidekjeder alternativt peker opp og ned, vinkelrett på arkets plan.
betraktninger
Polypeptidene kan omfatte flere betablater og alfa-helix-delene som deler av deres totale 3-D-struktur eller den tertiære struktur. Et enkelt polypeptid kan være et protein alene, eller flere kan binde for å danne et protein. Hvis flere polypeptider er involvert, kalles deres romlige arrangement en kvaternær struktur. Den sekundære strukturen refererer spesielt til egenskapene til alfa helix og beta ark. Som den tertiære og kvaternære strukturen kan den sekundære strukturen bli uordnet eller denaturert ved anvendelse av høye temperaturer og / eller signifikante endringer i pH.