Innhold
Peptider er fragmenter av korte polymerer sammensatt av aminosyrer. Hvert peptid har en viss sekvens av aminosyrer betegnet med en tre bokstavskode eller bare en; for eksempel forkortes aminosyren alanin som "Ala" eller "A". Belastningen av peptider i løsningen avhenger av surheten. Det isoelektriske punktet (pI) refererer til surhetsverdien til løsningen der peptidmolekylet har en nettolading lik null. Løseligheten til peptidet er minimal ved det isoelektriske punktet. Bruk tilgjengelige webservere til å beregne pI-verdien for en aminosyresekvens av et peptid.
Trinn 1
Sekvens peptidet ved hjelp av enbokstavskoden. For eksempel, hvis et peptid har en Ala-Ser-Glu-Leu-Pro aminosyresekvens (Alanin - Serin - Glutaminsyre - Leucin - Proline), vil sekvensen med en bokstav være "ASELP". Hvis det er nødvendig, kan du se konverteringstabellen med en bokstav til tre bokstaver som er gitt i seksjonen Ressurser.
Steg 2
Bruk hvilken som helst nettleser, for eksempel Internet Explorer eller Firefox, til å angi en server som beregner det isoelektriske punktet til et peptid (pI); se Ressurser.
Trinn 3
Skriv en-bokstavssekvensen til peptidet - i vårt eksempel, "ASELP" - i boksen og klikk "Beregn".
Trinn 4
Les verdien av det isoelektriske punktet (pI) gitt i linjen "Teoretisk pI / Mw" (teoretisk pl). I vårt eksempel er pI 4,00. Merk at serveren også beregner peptidets molekylvekt (Mw).